TBE-尿素-PAGE電(diàn)泳可以選擇RTM501 單鏈DNA Marker(25-75 nt)和RTM506 單鏈DNA Marker (15-120nt)作為(wèi)分子量标準。
DNA尿素PAGE電(diàn)泳試劑盒
DNA Urea PAGE
Electrophoresis Kit
貨号
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名稱
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規格
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RTE4102
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DNA尿素PAGE電(diàn)泳試劑盒
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60次
(1mm厚12%膠)
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● 産品組成:
貨号
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名稱
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規格
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保存條件(jiàn)
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AC2914-01
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40%PAA(29:1)
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100 ml
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4℃
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TB002
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10×TBE
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500 ml
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RT
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RU5080
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尿素(電(diàn)泳級)
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220 g
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RT
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AP020P
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APS(幹粉)
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5 ml
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RT (配制後-20℃貯存)
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TA0761-01
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TEMED
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0.5 ml
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4℃,避光(guāng)
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DL080-01
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2×TBE尿素上(shàng)樣緩沖液 (尿素變性膠)
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1 ml
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4℃
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● 産品簡介:
DNA尿素 PAGE 電(diàn)泳是研究寡核苷酸電(diàn)泳的重要研究手段。可以檢測2-500堿基的寡核苷酸片段,理論上(shàng)可以分辨出相(xiàng)差一(yī)個(gè)核苷酸的片段。
本公司提供的DNA尿素PAGE電(diàn)泳試劑盒包含凝膠制備及電(diàn)泳所需的全部試劑,用戶隻需自(zì)備制膠器(qì)具和蒸餾水(shuǐ),即可配制各種濃度的PAGE膠,使用方便。
按照(zhào)每次制備7 ml 10%凝膠(大小(xiǎo)10×8cm,1mm厚度)計算(suàn),試劑盒可使用至少60次。
● 貯存和運輸:
試劑盒按照(zhào)标簽溫度貯存,有效期一(yī)年(nián)。試劑盒常溫運輸。
● 使用說明:
一(yī)、制備凝膠:
10% APS配制-5 ml:
将0.5 gAPS幹粉溶于5 ml滅菌水(shuǐ)中,徹底溶解後分裝,1 ml/支,-20℃備存,每次取一(yī)管使用。10% APS應盡量減少室溫存放(fàng)時間,以防失效。10%APS在4℃有效期為(wèi)一(yī)周,-20℃有效期12個(gè)月(yuè)。若發現凝膠聚合時間延長(cháng),應考慮更換使用-20度保存的10% APS。
1.1.參照(zhào)凝膠模具說明書,裝配好凝膠模具。
1.2.分離膠配制:根據表格一(yī),将不同體積的成分混合,漩渦攪拌至尿素徹底溶解。
表一(yī) TBE-尿素PAGE分離膠配方表 (總體積5 ml,适用于厚度1.0 mm小(xiǎo)闆膠)
單鏈DNA長(cháng)度
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最佳凝膠濃度
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尿素(克)
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40%PAA
(29:1)
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10×TBE
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補水(shuǐ)到(dào)總體積
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10%APS
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TEMED
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200-1000 nt
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5%
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2.1克
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0.625 ml
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0.5 ml
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5 ml
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50 μl
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5 μl
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50-400 nt
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8%
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2.1克
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1 ml
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0.5 ml
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5 ml
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50 μl
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5 μl
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40-350 nt
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10%
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2.1克
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1.25 ml
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0.5 ml
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5 ml
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50 μl
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5 μl
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30-300 nt
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12%
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2.1克
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1.5 ml
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0.5 ml
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5 ml
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50 μl
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5 μl
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10-150 nt
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15%
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2.1克
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1.875 ml
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0.5 ml
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5 ml
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50 μl
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5 μl
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8-120 nt
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20%
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2.1克
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2.5 ml
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0.5 ml
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5 ml
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50 μl
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5 μl
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1.3在凝膠模具中灌入适量分離膠溶液(對于mini-gel,凝膠液加至約距前玻璃闆頂端1.5 cm或距梳齒約0.5 cm即可),然後在分離膠溶液上(shàng)輕輕覆蓋一(yī)層1-5
cm的水(shuǐ)層,使凝膠表面保持平整。
1.4靜(jìng)置10-20分鍾,待分離膠和水(shuǐ)層之間出現一(yī)個(gè)清晰的界面後,說明凝膠已聚合。
注:凝膠的聚合時間與環境溫度有關。夏天溫度較高(gāo)時,聚合較快;冬天氣溫低(dī)時,聚合時間會(huì)延長(cháng)。可以根據環境溫度的不同調節APS的加入量。
1.5去除覆蓋在分離膠上(shàng)的水(shuǐ)層;按照(zhào)表二将不同體積成分在一(yī)個(gè)小(xiǎo)燒杯中混合;最後加入10%過硫酸铵和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免産生(shēng)氣泡。
表二 TBE-尿素PAGE 4%濃縮配方表 (總體積2 ml,适用于1.0mm厚度膠)
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各組份體積(ml)
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凝膠濃度
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尿素
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40%PAA(29:1)
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10×TBE
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滅菌水(shuǐ)
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10%APS
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TEMED
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4%
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0.84克
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0.2 ml
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0.2 ml
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補水(shuǐ)2 ml
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20 μl
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2 μl
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1.6将濃縮膠溶液加至分離膠的上(shàng)面,直至凝膠溶液到(dào)達前玻璃闆的頂端;将梳子插入凝膠内,避免産生(shēng)氣泡。
1.7靜(jìng)置30-60分鍾,等待濃縮膠聚合。
注:凝膠的聚合時間與環境溫度有關。夏天溫度較高(gāo)時,聚合較快;冬天氣溫低(dī)時,聚合時間會(huì)延長(cháng)。可以根據環境溫度的不同調節APS的加入量。
二、電(diàn)泳:
2.1. 預電(diàn)泳:拔出梳子,用1×TBE緩沖液徹底沖洗加樣孔2-3次,去除殘餘的尿素。電(diàn)泳槽内外加入适量1×TBE緩沖液穩壓200 V預電(diàn)泳30分鍾。
注:試劑盒配套的10×TBE緩沖液僅夠配制凝膠用,1×TBE電(diàn)泳緩沖液請自(zì)己制備,配方如下(xià):
終濃度
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順序
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原料
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1升
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5 升
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89 mM
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1
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Tris堿 [MW121.14]
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10.8 克
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54克
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2 mM
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2
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EDTA 2Na·2H2O [MW372.24]
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0.744 克
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3.72克
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89 MM
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3
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硼酸 [MW61.83]
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5.5 克
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27.5克
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4
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超純水(shuǐ)最後定容至
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1 升
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5 升
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最後pH在8.2-8.3之間,可以不用調節pH,記錄每批pH
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2.2. 取 3-5
μl樣品,加入等體積2×TBE尿素上(shàng)樣緩沖液,70℃處理5 分鍾後立即冰浴,上(shàng)樣。
2.3. 連接電(diàn)源線,打開(kāi)電(diàn)源開(kāi)關,按照(zhào)以下(xià)條件(jiàn)電(diàn)泳。
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恒電(diàn)壓
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起始電(diàn)流
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結束電(diàn)流
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電(diàn)泳時間
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适用條件(jiàn)
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推薦電(diàn)壓
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200V
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15-20 mA/闆膠
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10-15 mA/闆膠
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60+ min
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最佳電(diàn)壓,最優的分辨率
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2.4. 等待上(shàng)樣緩沖液的溴酚藍指示前沿到(dào)凝膠底部時終止電(diàn)泳,取出凝膠進行後續實驗。
變性膠濃度
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溴酚藍
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二甲苯菁
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5%
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35 nt
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130 nt
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8%
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19 nt
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75 nt
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10%
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15 nt
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55 nt
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15%
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10 nt
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52 nt
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三、染色:
3.1 單鏈DNA可以用單鏈DNA PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(貨号:RTS5103),核酸PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(貨号:RTS5102)或核酸快速銀(yín)染試劑盒(貨号:RTS5101)進行染色。
● 實驗示例:
1.
使用單鏈DNA
PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(貨号:RTS5103)染色:
2. 使用核酸PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(貨号:RTS5102)染色:
3. 使用RealSafe Red核酸染料(貨号:GR002)染色:
4 使用核酸快速高(gāo)靈敏度染色試劑盒(貨号:RTS5101)染色:
使用RTE4102 DNA尿素PAGE電(diàn)泳試劑盒 産品發表部分文章列表:
1. [2022 IF=9.23] Precision-SELEX aptamer
screening for the colorimetric and fluorescent dual-readout aptasensing of AFB
in food.
Author: Ying Li, Boyu Jia, Pengyue Song, Nan
Long, Linchun Shi, Peng Li, Jiabo Wang,Lidong Zhou, Weijun Kong
Product: RTE4102 DNA尿素PAGE電(diàn)泳試劑盒
Journal: Food Chemistry 436 (2024) 137661
Institution:School of Traditional Chinese Medicine,
Capital Medical University
Paper link: https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2023.137661