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單鏈DNA Marker(20-75 nt)

單鏈DNA Marker(20-75 nt)

産品編号:RTM501

産品規格:25次

數量
價格 ¥500

單鏈DNA Marker20-75 nt                       

 

貨号

名稱

規格

RTM501

單鏈DNA Marker20-75 nt

25

 

● 産品編号及規格:

貨号

名稱

規格

貯存

RTM501-01

單鏈DNA Marker20-75 nt

25次(125 μl

-20℃

DL080-01

2×TBE尿素上(shàng)樣緩沖液

1 ml

4℃-20℃

● 産品簡介:

單鏈DNA Marker由不同長(cháng)度的單鏈DNA分子混合而成,7條帶的大小(xiǎo)為(wèi)20,25,30,35,40, 50,75 nt。35 nt 濃度約為(wèi)100 ng/μl,其餘條帶濃度約為(wèi)50 ng/μl。該産品已經含有上(shàng)樣緩沖液,使用前70度處理5分鍾後可以直接上(shàng)樣。該Marker适用于跑尿素變性膠,電(diàn)泳後使用單鏈DNA PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(Cat:RTS5103),核酸PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(Cat:RTS5102),核酸快速高(gāo)靈敏度染色試劑盒(Cat:RTS5101)或核酸染料如RealSafe Red(貨号:GR002)或RealSafe All(貨号:GR004)均可以得到(dào)清晰的條帶分離效果。

産品内附帶2×TBE尿素上(shàng)樣緩沖液(Cat:DL080-01),方便待檢樣品的上(shàng)樣。以每次上(shàng)樣5 μl計算(suàn),該産品可以使用大約25次。

●  保存條件(jiàn)和運輸:

-20℃貯存;有效期2年(nián);濕冰運輸。

● 使用方法:

注:以下(xià)使用方法均以8×10cm凝膠 1.0mm示例,其他規格凝膠請适當調整。

一(yī). 凝膠制備:

1.1 可以選擇DNA尿素PAGE電(diàn)泳試劑盒(Cat:RTE4102))或按照(zhào)以下(xià)程序制膠:

表一(yī) TBE-尿素PAGE分離膠配方表 (總體積5 ml,适用于厚度1.0 mm小(xiǎo)闆膠)

單鏈DNA長(cháng)度

最佳凝膠濃度

尿素(克)

40%PAA

29:1

10×TBE

補水(shuǐ)到(dào)總體積

10%APS

TEMED

200-1000 nt

5%

2.1

0.625 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

50-400 nt

8%

2.1

1 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

30-300 nt

10%

2.1

1.25 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

10-150 nt

15%

2.1

1.875 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

5-120 nt

20%

2.1

2.5 ml

0.5 ml

5 ml

50 μl

5 μl

 1.2在凝膠模具中灌入适量分離膠溶液(對于mini-gel,凝膠液加至約距前玻璃闆頂端1.5 cm或距梳齒約0.5 cm即可),然後在分離膠溶液上(shàng)輕輕覆蓋一(yī)層1-5 cm的水(shuǐ)層,使凝膠表面保持平整。

1.3靜(jìng)置10-20分鍾,待分離膠和水(shuǐ)層之間出現一(yī)個(gè)清晰的界面後,說明凝膠已聚合。

注:凝膠的聚合時間與環境溫度有關。夏天溫度較高(gāo)時,聚合較快;冬天氣溫低(dī)時,聚合時間會(huì)延長(cháng)。可以根據環境溫度的不同調節APS的加入量。

1.4去除覆蓋在分離膠上(shàng)的水(shuǐ)層;按照(zhào)表二将不同體積成分在一(yī)個(gè)小(xiǎo)燒杯中混合;最後加入10%過硫酸铵和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免産生(shēng)氣泡。

表二 TBE-尿素PAGE 4%濃縮配方表 (總體積2 ml,适用于1.0mm厚度膠)

各組份體積(ml

凝膠濃度

尿素

40%PAA29:1

10×TBE

滅菌水(shuǐ)

10%APS

TEMED

4%

0.84

0.2 ml

0.2 ml

補水(shuǐ)至體積2 ml

20 μl

2 μl

1.5将濃縮膠溶液加至分離膠的上(shàng)面,直至凝膠溶液到(dào)達前玻璃闆的頂端;将梳子插入凝膠内,避免産生(shēng)氣泡。

1.6靜(jìng)置30-60分鍾,等待濃縮膠聚合。

注:凝膠的聚合時間與環境溫度有關。夏天溫度較高(gāo)時,聚合較快;冬天氣溫低(dī)時,聚合時間會(huì)延長(cháng)。可以根據環境溫度的不同調節APS的加入量。

. 樣品制備:

2.1 取适量體積單鏈DNA Marker樣品(不用添加上(shàng)樣緩沖液);待測樣品與等體積的2×TBE尿素上(shàng)樣緩沖液(Cat:DL080-01)混合,70℃處理5分鍾,冰浴制冷後待上(shàng)樣。

.電(diàn)泳:

3.1. 預電(diàn)泳(可選):電(diàn)泳槽内外加入适量1×TBE緩沖液穩壓200V預電(diàn)泳30分鍾。電(diàn)泳結束後,1×TBE緩沖液徹底沖洗加樣孔2-3次,去除殘餘的尿素

3.2.上(shàng)樣:根據梳齒确定Marker上(shàng)樣量, 一(yī)般是10齒1mm厚梳子上(shàng)樣5 μl,15齒1mm厚梳子上(shàng)樣3 μl。

3.3. 連接電(diàn)源線,打開(kāi)電(diàn)源開(kāi)關,按照(zhào)以下(xià)條件(jiàn)電(diàn)泳。

 

恒電(diàn)壓

起始電(diàn)流

結束電(diàn)流

電(diàn)泳時間

适用條件(jiàn)

推薦電(diàn)壓

200 V

15-20 mA/闆膠

10-15 mA/闆膠

60+ min

最佳電(diàn)壓,最優的分辨率


3.4. 等待上(shàng)樣緩沖液的溴酚藍指示前沿到(dào)凝膠底部時終止電(diàn)泳,取出凝膠進行後續實驗。

變性膠濃度

溴酚藍

二甲苯菁

5%

35 nt

130 nt

8%

19 nt

75 nt

10%

15 nt

55 nt

15%

10 nt

52 nt

20%

8 nt

35 nt

四.染色:

用單鏈DNA PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(Cat:RTS5103),核酸PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(Cat:RTS5102)或核酸快速高(gāo)靈敏度染色試劑盒(Cat:RTS5101)染色均可以得到(dào)清晰的條帶分離效果。注:如果使用核酸染料染色,RealSafe Red(貨号:GR002)或RealSafe All(貨号:GR004)核酸染料結合單鏈核酸效果最佳,強烈建議使用以便獲得最佳效果的膠圖。其餘染料如GelRed,Goldview,EB等染色效果不好。

● 注意事(shì)項:

1. 單鏈DNA Marker産品适用于變性PAGE垂直電(diàn)泳,不适用于水(shuǐ)平瓊脂糖凝膠電(diàn)泳。


● 電(diàn)泳示例:

1. 使用單鏈DNA PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(貨号:RTS5103)染色:


2. 使用核酸PAGE電(diàn)泳染色試劑盒(貨号:RTS5102)染色:

3. 使用RealSafe Red核酸染料(貨号:GR002)染色:


4. 使用核酸快速高(gāo)靈敏度染色試劑盒(貨号:RTS5101)染色


 

 

使用RTM501 單鏈DNA Marker20-75 nt發表部分文章列表:

 

1. [2021 IF=3.532] Real-time detection of SARS-CoV-2 in clinical samples via ultrafast ligation-dependent RNA transcription amplification

Marker :RTM501,單鏈DNA Marker(20-75 nt)

Author: Peng Zhang, Yang Li, Dongmei Zhang, Xinghao Zhu, Jinling Guo, Cuiping Ma and Chao Shi

Journal: Analytical Methods 2023, 15,1915

Institution Qingdao University

Paper linkhttps://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2023/AY/D3AY00093A

 


 
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