高(gāo)分子量蛋白(bái)(大于150 kD)Western Blot攻略
高(gāo)分子量蛋白(bái)(大于150
kD)Western Blot攻略
注:該文引自(zì)基因幫公衆号天才試劑君文章,略有修改。 Ver.730875
● 一(yī) 選對凝膠很重要
三種最常見(jiàn)的凝膠系統包括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate系統。
Tris-Glycine凝膠的pH為(wèi)8.6,且保質期很短,一(yī)般4-8℃保存有效期一(yī)個(gè)月(yuè)。在跑膠的過程中,凝膠系統的pH還(hái)有上(shàng)升的趨勢,可達到(dào)9.5,這會(huì)導緻蛋白(bái)降解和低(dī)分辨率。
Bis-Tris凝膠的pH為(wèi)~6.5,相(xiàng)對Tris-Glycine凝膠,穩定性和保質期都有所增加,4-8℃貯存可以保存一(yī)年(nián)。但這種凝膠更适合于低(dī)分子量電(diàn)泳分離(低(dī)于200 kD),不适合高(gāo)分子量蛋白(bái)電(diàn)泳。
Tris-Acetate 凝膠的pH為(wèi)~7,跑大分子蛋白(bái)會(huì)呈現很高(gāo)的分辨率,同時4-8℃貯存可以保存一(yī)年(nián)。
所以跑大分子蛋白(bái)時,我們推薦使用Tris-Acetate 凝膠(貨号:RTD6162;RTD6155)。
● 二 凝膠濃度很重要
既然選擇了Tris-Acetate 凝膠,要考慮凝膠濃度的問題。凝膠濃度與孔徑成反比:濃度越小(xiǎo),孔越大,較大的蛋白(bái)質更容易通(tōng)過較大的孔,所以建議使用低(dī)百分比的Tris醋酸凝膠(貨号:RTD6162),如6%等度膠。也可以使用梯度凝膠,但是制作梯度凝膠會(huì)恨棘手,需要一(yī)個(gè)梯度凝膠生(shēng)成系統(貨号:RT-GZY02),不過現在很多(duō)公司都會(huì)出售具有不同範圍的梯度預制膠(貨号:RTD6155),節省時間。
● 三 電(diàn)泳内槽緩沖液需要添加抗氧化劑
Tris-醋酸電(diàn)泳使用10×Tris-醋酸-SDS電(diàn)泳緩沖液(貨号:TA050),經典的Tris-甘氨酸-SDS電(diàn)泳緩沖液無法兼容使用。由于DTT在pH中性時,基本不随著(zhe)樣品泳動,為(wèi)保證蛋白(bái)樣品在電(diàn)泳中維持還(hái)原力,Tris-Acetate 凝膠電(diàn)泳時,電(diàn)泳槽内槽緩沖液需要添加抗氧化劑(貨号:TA1510),這樣可以保證整個(gè)電(diàn)泳過程中蛋白(bái)的變性還(hái)原狀态,提高(gāo)樣品的分辨率。
● 四 提高(gāo)轉膜緩沖液中的SDS,減少甲醇
高(gāo)分子量蛋白(bái)轉膜緩沖液中的組成至關重要。如果有甲醇存在,大分子蛋白(bái)很容易沉澱,可以通(tōng)過減少轉膜緩沖液中的甲醇百分比(10%或更低(dī))來避免這種情況發生(shēng)。為(wèi)了進一(yī)步确保蛋白(bái)質不會(huì)沉澱,考慮在轉膜緩沖液中添加SDS至終濃度為(wèi)0.05%-0.1%。SDS向蛋白(bái)添加均勻的負電(diàn)荷,使得它們更容易從(cóng)凝膠轉移到(dào)膜上(shàng)。高(gāo)分子量蛋白(bái)的轉膜緩沖液可以選擇10×Tris-醋酸轉膜緩沖液(濕轉,粉末型)(貨号:TA5030P)
● 五 選擇合适的轉印膜
轉印膜一(yī)般有PVDF膜或NC膜,跑大分子蛋白(bái)建議選擇PVDF膜。如前面所說,如果有甲醇存在,大分子蛋白(bái)很容易沉澱。而PVDF膜可以不需要在轉膜緩沖液中添加甲醇,目的蛋白(bái)轉印的機(jī)會(huì)更高(gāo)。PVDF膜有各種孔徑尺寸,最常見(jiàn)的是0.22 μm和0.45
μm。與凝膠一(yī)樣,較大的蛋白(bái)比較小(xiǎo)的蛋白(bái)更容易穿過大孔隙。高(gāo)分子量蛋白(bái)質可以用0.45μm膜(貨号:ML-PV-131545-5)轉移,避免使用0.22 μm孔徑。
● 六 增加轉印時間
在正确的選擇完凝膠、轉印膜及轉移緩沖液後,轉印正式開(kāi)始。半幹轉快且方便,但不适用于大分子蛋白(bái)。大分子蛋白(bái)建議濕轉,因為(wèi)大分子蛋白(bái)轉移時間很慢(màn),推薦350-400 mA轉移90 min或 4℃,40 mA,轉印過夜。
● 七 關于轉印膜封閉
沒有任何一(yī)種封閉試劑能(néng)通(tōng)用于蛋白(bái)封閉。BSA通(tōng)常作為(wèi)NC膜的封閉液,但是對于PVDF膜,它的封閉效果并不是最好。大蛋白(bái)轉膜後的封閉可以選擇5%脫脂奶粉(貨号:WN1070)。
另外,不要讓PVDF膜在檢測過程中的任何時間點幹透,如果膜部分變幹,可以讓膜完全幹掉,然後用甲醇重新潤濕,之後用緩沖液浸泡,繼續操作。