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Blue Native PAGE凝膠電(diàn)泳常見(jiàn)問題

Blue Native PAGE凝膠電(diàn)泳常見(jiàn)問題

1. 在非變性條件(jiàn)下(xià),使用Blue Native PAGE凝膠進行非變性電(diàn)泳比使用Tris-甘氨酸凝膠具有哪些優勢?

需要使用非離子洗滌劑進行增溶的樣品不能(néng)兼容傳統的非變性Tris-甘氨酸PAGE,因為(wèi)随著(zhe)蛋白(bái)質在聚丙烯酰胺凝膠中的遷移,會(huì)将非離子洗滌劑遺留在條帶上(shàng)方。當缺少非離子洗滌劑時,蛋白(bái)質會(huì)聚集并在泳道頂部形成垂直線條。當使用藍色非變性電(diàn)泳(Blue Native PAGE凝膠)時,Coomassie G-250可顯著減少蛋白(bái)質的聚集,有效分離膜上(shàng)的蛋白(bái)質複合物(wù),達到(dào)Tris-甘氨酸凝膠上(shàng)得不到(dào)的效果。此外,與Tris-甘氨酸系統的工(gōng)作pHpH 9.3–9.5)相(xiàng)比,Blue Native PAGE凝膠較低(dī)的工(gōng)作pHpH 7.5–7.7)有助于維持堿性pH敏感型蛋白(bái)質的非變性結構和/或活性。

2. Blue Native PAGE凝膠應如何保存?

我們推薦将其保存在4-8℃。不可冷凍。

3. Blue Native PAGE凝膠的蛋白(bái)分離範圍是多(duō)少?

3-12%RealPAGE Native BN/CN 預制膠可分離分子量在45–10,000 kD範圍内的蛋白(bái)質。

4-16%RealPAGE Native BN/CN 預制膠可分離分子量在25–10,000 kD範圍内的蛋白(bái)質。

4. Blue Native PAGE凝膠的推薦樣品上(shàng)樣體積和蛋白(bái)質上(shàng)樣量是多(duō)少?

我們提供的預制膠是12孔,每個(gè)孔的最大上(shàng)樣體積為(wèi)30 μl,推薦每個(gè)泳道的蛋白(bái)含量範圍在20-50 μg

5. 我的Blue Native PAGE凝膠在電(diàn)泳過程中停止電(diàn)泳了,為(wèi)什麽?該如何繼續電(diàn)泳?

Blue Native PAGE凝膠電(diàn)泳期間,電(diàn)流下(xià)降至低(dī)于1 mA很常見(jiàn)。有些電(diàn)泳電(diàn)源如伯樂電(diàn)源有負載檢查功能(néng),電(diàn)流過低(dī)(低(dī)于4mA) 會(huì)認為(wèi)沒有負載,報(bào)錯(cuò)E1錯(cuò)誤代碼,終止電(diàn)泳。解決方法是更換電(diàn)泳電(diàn)源,如使用國(guó)産電(diàn)源;另外可以調高(gāo)電(diàn)壓高(gāo)于300 V,使得電(diàn)流不要低(dī)于4mA

推薦使用RTD6137 非變性電(diàn)泳蛋白(bái)質Marker45-880 kD),RTD6142 高(gāo)分子量非變性電(diàn)泳蛋白(bái)質Marker II45-669 kD)或者RTD6144 寬分子量非變性電(diàn)泳蛋白(bái)質Marker 21-880 kD。然而由于凝膠濃度較低(dī),低(dī)于45 kD條帶會(huì)壓在前沿,可能(néng)不可見(jiàn)。

Blue Native PAGE電(diàn)泳中,不能(néng)使用預染分子量Marker,因為(wèi)所有的預染蛋白(bái)分子量Marker都是經過變性和還(hái)原的,在非變性凝膠上(shàng)不能(néng)良好分離。

請注意,即使使用非變性分子量Marker,在非變性電(diàn)泳中的分子量預估也是非常不精确的,因為(wèi)各蛋白(bái)質的不同電(diàn)荷和結構會(huì)嚴重影響凝膠遷移。為(wèi)獲得更精确的預估,可使用質譜分析或排阻層析(SEC)。

7. 你們推薦對Blue Native PAGE凝膠使用哪種染色方法?

Blue Native PAGE凝膠可兼容大多(duō)數标準Coomassie R-250G-250染料配方。推薦使用FastBlue蛋白(bái)染色液(貨号:RTD6202)。

8. 5% G-250染料的作用是什麽?是否含有洗滌劑?

5% G-250染料(貨号BC260)是一(yī)種濃縮型Coomassie G-250儲液,專為(wèi)與含有洗滌劑(非離子型)的Blue Native PAGE凝膠電(diàn)泳樣品一(yī)起使用而設計。該染料不含洗滌劑。正常情況下(xià),非變性蛋白(bái)在凝膠上(shàng)的遷移取決于凝膠緩沖液pH下(xià)的自(zì)然電(diàn)荷/等電(diàn)點,但是,加入Coomassie G-250會(huì)使蛋白(bái)質産生(shēng)負電(diàn)荷,即使是通(tōng)常具有正電(diàn)荷的高(gāo)pI蛋白(bái)質也能(néng)帶上(shàng)負電(diàn)。該添加劑能(néng)夠與蛋白(bái)質非特異性結合,能(néng)夠保持蛋白(bái)的非變性狀态。

9. 你們推薦選擇哪種轉膜緩沖液用于Blue Native PAGE凝膠轉印?

我們推薦選擇10×BN轉膜緩沖液(貨号:BC600P)用于Blue Native PAGE凝膠轉印。PVDF是推薦使用的印迹膜,具有良好的轉印和檢測效果。硝酸纖維素膜(NC膜)不能(néng)兼容Blue Native PAGE凝膠轉印,這是因為(wèi)硝酸纖維素膜可與Coomassie G-250染料發生(shēng)緊密結合,很難脫離幹淨。

10. 對于Blue Native PAGE凝膠,你們推薦的轉膜條件(jiàn)是什麽?

由于Blue Native PAGE電(diàn)泳基本關注的是分子量比較大的蛋白(bái)或複合體,推薦使用濕轉法轉膜,不推薦用半幹轉方法轉膜。使用BN轉膜緩沖液,以下(xià)轉膜條件(jiàn)僅供參考,客戶針對自(zì)己的目的蛋白(bái),最好經過1-2次預實驗後,确定最佳的轉膜條件(jiàn)。

蛋白(bái)大小(xiǎo)

穩流

建議時間

降溫措施

低(dī)于70kD

150 mA

小(xiǎo)時

不需要

70-300 kD

200 mA

1.5-2 小(xiǎo)時

需要

高(gāo)于300 kD

200 mA

2.5-3.5 小(xiǎo)時

需要

11. 凝膠轉膜後,我的PVDF膜染上(shàng)藍顔色了怎麽辦?

由于電(diàn)泳緩沖液和上(shàng)樣緩沖液中含有考馬斯亮藍G-250,凝膠轉膜後PVDF膜會(huì)有藍色痕迹,可以把膜浸泡在無水(shuǐ)甲醇中漂洗幾分鍾,去除藍色。

12. 非變性Marker轉到(dào)膜上(shàng)看(kàn)不到(dào)條帶,Western Blot檢測後我如何判斷條帶大小(xiǎo)呢(ne)?


有兩種方法可以解決非變性Marker轉膜後條帶顯示問題:

第一(yī)種方法:凝膠轉膜後用麗春紅(hóng)染色液(貨号:RTD6301)染膜,可以看(kàn)到(dào)Marker條帶,順便可以檢測轉膜效率,然而要注意的是麗春紅(hóng)染色靈敏度比較低(dī),可能(néng)不能(néng)完全看(kàn)到(dào)完整的Marker條帶。


       注:北(běi)京師(shī)範大學惠贈圖片

第二種方法(下(xià)圖):電(diàn)泳結束後,把含有Marker泳道的凝膠切下(xià),單獨用考馬斯亮藍染色液染色(貨号:RTD6202),剩餘的凝膠去完成轉膜到(dào)ECL發光(guāng)檢測過程,最後的發光(guāng)結果和Marker染色結果拼接判斷條帶範圍。


Jurkat細胞BN電(diàn)泳 GAPDH檢測 
凝膠: 8% BN凝膠(貨号:RTD6140 
電(diàn)泳:1×藍色電(diàn)泳緩沖液(含0.01% G-250) 
穩壓150V 43分鍾;1×無色電(diàn)泳緩沖液 穩壓150V 35分鍾 
轉膜:1×BN轉膜緩沖液(不含甲醇),穩流200 mA 
(電(diàn)壓72-60V) 1.5小(xiǎo)時,未冰浴 
膜漂洗去藍色:PVDF膜無水(shuǐ)甲醇浸泡10分鍾至膜無色 
封閉:無蛋白(bái)快速封閉(貨号:PF1070),RT,30分鍾 
一(yī)抗:GAPDH兔多(duō)抗(貨号:RGA1040),1:5000 過夜孵育 
二抗:羊抗兔IgG-HRP(貨号:HGR1020) 1:5000 RT 1小(xiǎo)時 
ECL檢測:ECL發光(guāng)(貨号:EC2520),曝光(guāng)3.5 min