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細菌基因組DNA提取試劑盒

細菌基因組DNA提取試劑盒

産品編号:RTG2401-02

産品規格:100次

相(xiàng)關規格:
數量
價格 ¥720

細菌基因組DNA提取試劑盒目錄号:RTG2401)


試劑盒組成

RTG2401-01

50次)

RTG2401-02

100次)

貯存方式

緩沖液GA

15 ml

30 ml

室溫

緩沖液GB

15 ml

30 ml

室溫

去蛋白(bái)液GD(濃縮液)

18 ml

36 ml

室溫

漂洗液PW(濃縮液)

25 ml

25 ml

室溫

洗脫緩沖液EB

15 ml

2×15 ml

室溫

蛋白(bái)酶K20 mg/ml

1 ml

2×1 ml

-20

溶菌酶(5 mg/ml

1ml

2×1ml

-20

RNase A10 mg/ml

0.5 ml

1 ml

-20

吸附柱CG

50個(gè)

100個(gè)

室溫

收集管(2 ml

50個(gè)

100個(gè)

室溫

說明書

1

1

 

試劑盒内容及保存:

儲存、效期及運輸:

本試劑盒在常溫(25℃左右)幹燥條件(jiàn)下(xià),可保存1年(nián);更長(cháng)時間的保存可置于2-8℃。2-8℃保存條件(jiàn)下(xià),若溶液産生(shēng)沉澱,應在使用前置于37℃下(xià)溶解沉澱至溶液澄清後再使用。單獨包裝的蛋白(bái)酶K、溶菌酶和RNaseA收到(dào)後-20℃保存。

蛋白(bái)酶K、溶菌酶和RNase A濕冰運輸,其餘組份常溫運輸。

産品簡介:

本試劑盒采用可以特異性結合DNA的離心吸附柱和獨特的緩沖液系統提取細菌(革蘭氏陽性菌和陰性菌)的基因組DNA。溶菌酶能(néng)有效去除細菌細胞壁;蛋白(bái)酶K能(néng)把核酸解離出來; RNaseA能(néng)去除痕量的RNA污染;離心吸附柱能(néng)夠高(gāo)效、專一(yī)吸附DNA,最大限度去除雜(zá)質蛋白(bái)及細胞中其他有機(jī)化合物(wù),提取的基因組DNA片段大,純度高(gāo),質量穩定可靠。

使用本試劑盒回收的DNA可适用于各種常規操作,包括酶切、PCR、文庫構建、Southern雜(zá)交等實驗。

提取得率:

材料

提取量

DNA得量

細菌培養液

108–1010 cells

10-20 μg(革蘭氏陰性菌)

   6-10 μg(革蘭氏陽性菌)

準備工(gōng)作:

1. 準備55℃和70℃水(shuǐ)浴;無水(shuǐ)乙醇;1.5 ml滅菌離心管。

2. 按照(zhào)标簽所示在去蛋白(bái)液GD和漂洗液PW中加入無水(shuǐ)乙醇,混勻後蓋緊瓶蓋後室溫貯存備用。

3. 每次使用前請檢查緩沖液GA,緩沖液GB和去蛋白(bái)液GD是否有沉澱生(shēng)成,如果出現沉澱,37℃溫浴至沉澱溶解後再使用。

 

操作步驟:

如非指出,所有離心步驟均為(wèi)使用台式離心機(jī)在室溫下(xià)離心。

1. 取細菌培養液1-2 ml,10,000 g離心1分鍾,盡量吸淨上(shàng)清;向細菌沉澱中加入180 μl EB,旋渦混勻後加入18 μl 溶菌酶,室溫放(fàng)置10-15分鍾,期間間歇混勻幾次。

注:溶菌酶的用量和處理時間與處理的細菌種類密切相(xiàng)關,用戶可以根據細菌種類進行調節。如革蘭氏陽性菌應将處理時間延長(cháng)到(dào)30-60分鍾。

2.10,000g離心1分鍾,吸棄大部分上(shàng)清,留下(xià)約10 μl液體,徹底混勻。

   注:由于餘留的液體較少,徹底混勻菌體不太容易,用手指彈動管壁附加槍頭反複吹打既能(néng)完全混勻菌體。混勻一(yī)定要徹底,否則容易導緻步驟8中離心柱堵塞。

3. 向菌體沉澱中加入200 μl緩沖液GA,混勻。

4. 向管中加入20 μl 蛋白(bái)酶K,混勻,55℃處理15-30分鍾,期間間歇混勻2-3次至溶液清亮。

   :加入蛋白(bái)酶K後會(huì)産生(shēng)絮狀物(wù),消化徹底的标志(zhì)是絮狀物(wù)完全消失,溶液變清亮。如消化不徹底,會(huì)導緻步驟8中離心柱堵塞。

5. 加入10 μl RNaseA(10 mg/ml)溶液,混勻後室溫放(fàng)置2分鍾。

6. 加入220 μl緩沖液GB,混勻,70℃放(fàng)置10-30分鍾(對于革蘭氏陽性菌,時間應延長(cháng)到(dào)60分鍾)。

注:加入緩沖液GB時可能(néng)會(huì)産生(shēng)白(bái)色沉澱,一(yī)般70℃放(fàng)置相(xiàng)應時間後溶液會(huì)變清亮。如溶液未變清亮,應延長(cháng)70℃處理時間。如果絮狀物(wù)不能(néng)處理幹淨,容易導緻步驟8中離心柱的堵塞。

7. 加入220 μl無水(shuǐ)乙醇,充分混勻。

注:加入乙醇後會(huì)産生(shēng)絮狀沉澱,可用槍頭反複抽打1-2次将沉澱弄碎後再上(shàng)柱。如果絮狀物(wù)未做處理,容易導緻步驟8中離心柱的堵塞。

8. 将上(shàng)一(yī)步所得溶液和絮狀沉澱加入到(dào)吸附柱CG中(吸附柱放(fàng)入收集管中),11,000g離心5分鍾,倒掉廢液,吸附柱CG放(fàng)入收集管中。

:如果出現吸附柱堵塞現象,可将離心時間延長(cháng)到(dào)10分鍾。

9. 向吸附柱CG中加入500 μl去蛋白(bái)液GD(使用前請先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇),11,000 g離心2分鍾,倒掉廢液,吸附柱放(fàng)入收集管中。

10. 向吸附柱CG中加入700 μl漂洗液PW(使用前請先檢查是否已加入無水(shuǐ)乙醇),11,000 g離心60秒(miǎo),倒掉廢液,吸附柱放(fàng)入收集管中。

11. 向吸附柱CG中加入500 μl 漂洗液PW,11,000 g離心60秒(miǎo),倒掉廢液。

12. 吸附柱CG放(fàng)回收集管中,11,000 g離心2分鍾。

:此步驟非常重要,其目的是将吸附柱中殘餘的漂洗液去除。漂洗液中乙醇的殘留會(huì)影響後續的酶反應(酶切、PCR等)實驗。

13. 将吸附柱CG轉入一(yī)個(gè)幹淨的1.5 ml離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50–100 μl經70水(shuǐ)浴預熱的洗脫緩沖液EB,室溫放(fàng)置2分鍾,11,000 g離心2分鍾。

= 洗脫緩沖液體積最好不少于50 μl,體積過小(xiǎo)影響回收效率。

=   洗脫液的pH值對于洗脫效率有很大影響。若用水(shuǐ)做洗脫液應保證其pH值在7.0-8.5範圍内,pH值低(dī)于7.0會(huì)降低(dī)洗脫效率。

14. DNA産物(wù)-20℃保存。

DNA濃度及純度檢測:

基因組DNA片段的大小(xiǎo)與樣品保存時間、操作過程中的剪切力等因素有關。提取的DNA片段可用瓊脂糖凝膠電(diàn)泳和紫外分光(guāng)光(guāng)度計檢測濃度與純度。可配制0.8-1.0%瓊脂糖凝膠,使用λ/HindIII判斷基因組的大小(xiǎo),完整的基因組大小(xiǎo)應在23 kb以上(shàng)。使用分光(guāng)光(guāng)度計檢測時, OD260/OD280比值應為(wèi)1.7-1.9之間,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水(shuǐ)洗脫,比值可能(néng)偏低(dī),但并不表明DNA純度不高(gāo)。

RTG2401 細菌基因組DNA提取試劑盒發表文章

1. [2022 IF=4.2] Screening of high-efciency nitrogen-fxing bacteria from the traditional Chinese medicine plant Astragalus mongolicus and its efect on plant growth promotion and bacterial communities in the rhizosphere.

Author: Zhiyong Shi, Xu Guo, Zhenhong Lei, Yuanyuan Wang, Zhenyu Yang, Jingping Niu and Jianping Liang

Product: RTG2401 細菌基因組DNA提取試劑盒

Journal: BMC Microbiology    (2023) 23:292

Institution College Of Life Sciences,Shanxi Agricultural University

Paper linkhttps://doi.org/10.1186/s12866-023-03026-1

 


 
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