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20bp DNA ladder(20-500 bp)

20bp DNA ladder(20-500 bp)

産品編号:RTM441

産品規格:50次

數量
價格 ¥500

20bp DNA ladder

● 産品編号及規格:

RTM441          50次 (250 μl)    

● 産品組成:

貨号

名稱

規格

RTM441-01

20bp DNA ladder

50次(250 μl

DL070

6×Native-PAGE DNA上(shàng)樣緩沖液

1 ml

DL020

6×DualColor DNA loading buffer (雙染料)

1 ml

● 産品簡介:

本産品是由13條帶狀雙鏈DNA條帶組成的精準定量Marker,适用于聚丙烯酰胺凝膠電(diàn)泳中DNA條帶大小(xiǎo)和含量的分析。13條帶的大小(xiǎo)分别為(wèi)20,40,60,80,100,120,140,160,180,200,300,400,500 bp。其中100bp和200bp條帶為(wèi)加亮帶,含量為(wèi)100ng/5μl,其餘條帶濃度為(wèi)50ng/5μl。

本産品為(wèi)雙鏈DNA Marker,适用于非變性的PAGE電(diàn)泳和瓊脂糖凝膠電(diàn)泳,不适用于尿素PAGE電(diàn)泳。由于片段較小(xiǎo),如使用瓊脂糖分離,建議使用高(gāo)分辨率瓊脂糖凝膠電(diàn)泳分離。

按照(zhào)每次上(shàng)樣5 μl計算(suàn),該産品可以使用50次。

● 儲存條件(jiàn):

 -20 貯存,有效期3年(nián)。

● 使用方法:

一(yī)、 TBE-PAGE凝膠分離:

1、制備凝膠步驟:

1.1參照(zhào)凝膠模具說明書,裝配好凝膠模具。

1.2按照(zhào)表一(yī)将不同體積的成分在小(xiǎo)燒杯或試管中混合;最後加入10%APS和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免産生(shēng)氣泡。

   注:20bp DNA ladder 适用于配制20%TBE-PAGE膠。

1.3在凝膠模具中灌入适量分離膠溶液(對于mini-gel,凝膠液加至約距前玻璃闆頂端1.5 cm或距梳齒約0.5 cm即可),然後在分離膠溶液上(shàng)輕輕覆蓋一(yī)層1-2 cm的無水(shuǐ)乙醇,使凝膠表面保持平整。

1.4靜(jìng)置10-20分鍾,待分離膠和乙醇層之間出現一(yī)個(gè)清晰的界面後,說明凝膠已聚合

表一(yī) TBE-PAGE分離膠配方表 (總體積5 ml,适用于1mm厚度小(xiǎo)闆膠)

各組份體積(ml

最佳DNA分離範圍

凝膠濃度

滅菌水(shuǐ)

30%PAA291

5×TBE

10%APS

TEMED

70-450 bp

6%

3

1.0

1.0

0.05

0.005

60-460 bp

8%

2.66

1.34

1.0

0.05

0.005

50-300 bp

10%

2.33

1.67

1.0

0.05

0.005

40-200 bp

12%

2

2.0

1.0

0.05

0.005

25-150 bp

15%

0.5

2.5

1.0

0.05

0.005

5-100 bp

20%

0.66

3.34

1.0

0.05

0.005

1.5去除覆蓋在分離膠上(shàng)的乙醇;按照(zhào)表二将不同體積成分在一(yī)個(gè)小(xiǎo)燒杯或試管中混合;最後加入10%過硫酸铵和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免産生(shēng)氣泡。

表二 TBE-PAGE 4%濃縮配方表 (總體積1.5 ml,适用于1mm厚度小(xiǎo)闆膠)

各組份體積(ml

凝膠濃度

滅菌水(shuǐ)

30%PAA291

5×TBE

10%APS

TEMED

4%

1.0

0.2

0.3

0.02

0.002

1.6将濃縮膠溶液加至分離膠的上(shàng)面,直至凝膠溶液到(dào)達前玻璃闆的頂端;将梳子插入凝膠内,避免産生(shēng)氣泡。

1.7靜(jìng)置30-60分鍾,等待濃縮膠聚合。

注:凝膠的聚合時間與環境溫度有關。夏天溫度較高(gāo)時,聚合較快;冬天氣溫低(dī)時,聚合時間會(huì)延長(cháng)。可以根據環境溫度的不同調節APS的加入量。

2、電(diàn)泳:

2.1 将凝膠闆固定在電(diàn)泳裝置上(shàng),往上(shàng)槽和下(xià)槽中加入1×TBE電(diàn)泳液,1 ml吸頭沖洗加樣孔1-2次。

2.2 取待測樣品,加入相(xiàng)應體積6×Native PAGE DNA上(shàng)樣緩沖液,如5 μl樣品加1 μl 上(shàng)樣緩沖液,短暫離心後取5-10 μl上(shàng)樣。 20bp DNA ladder  1 mm厚10齒梳子上(shàng)樣5 μl,其餘梳齒和厚度凝膠适量調整上(shàng)樣量。

2.3 連接電(diàn)源線,打開(kāi)電(diàn)源開(kāi)關。200V穩壓電(diàn)泳。至二甲苯菁指示前沿到(dào)達凝膠三分之二位置時結束電(diàn)泳(此時溴酚藍指示前沿已經跑出凝膠,不可見(jiàn))。

TBE-PAGE電(diàn)泳

恒電(diàn)壓

起始電(diàn)流

結束電(diàn)流

電(diàn)泳時間

200 V

20-25 mA/闆膠

10-15 mA/闆膠

70+min



3、染色:

3.1 漂洗:玻璃闆上(shàng)拆下(xià)凝膠後,适量蒸餾水(shuǐ)漂洗3-5分鍾。

3.2 染色液配制:

  TBE-PAGE膠可以使用EBRealSafe類染料後染染色,以下(xià)程序用RealSafe Red核酸染料(貨号:GR002)進行染色。即用型染色液配制:

 

即用型RealSafe核酸染色液

 

100 ml

1×TBE

100 ml

RealSafe Red核酸染料

20 μl

3.3染色和觀察:

  凝膠浸泡于即用型染色液中,常溫避光(guāng)搖床40-60 rpm染色30 分鍾。紫外光(guāng)下(xià)觀察。

二、 瓊脂糖凝膠分離:

1. 瓊脂糖凝膠制備:

  由于片段較小(xiǎo),建議選用高(gāo)分辨率瓊脂糖(貨号AR1036)制膠。

以下(xià)步驟以制備50 ml 3%凝膠為(wèi)例:

稱取1.5 g瓊脂糖于玻璃三角瓶中,加入50 ml 1×TAE,5 μl RealSafe Red核酸染料或其他核酸染料(如EB,GoldView),混勻,蓋好瓶蓋,微波爐中火加熱至沸騰,輕搖混勻,重複1-2次至瓊脂糖完全溶解,無可見(jiàn)顆粒。倒入制膠容器(qì)中,插好梳子,常溫凝固30-50分鍾至凝膠完全凝固。

2. 電(diàn)泳:

取待測樣品,加入相(xiàng)應體積6×DualColor DNA loading buffer,如10 μl樣品加2 μl 上(shàng)樣緩沖液,短暫離心後取5-10 μl上(shàng)樣。 20bp DNA ladder  1 mm厚10齒梳子上(shàng)樣5 μl,其餘梳齒和厚度凝膠适量調整上(shàng)樣量。

建議電(diàn)泳條件(jiàn):凝膠濃度為(wèi)3%,電(diàn)泳電(diàn)壓8-10 v/cm(單位電(diàn)壓指電(diàn)泳槽陰陽極之間的距離電(diàn)壓,如陰極陽極之間的距離為(wèi)20 cm,可以用160-200 V電(diàn)壓進行穩壓電(diàn)泳),待溴酚藍指示前沿距離凝膠末端2 cm時終止電(diàn)泳,電(diàn)泳時間35-40分鍾。

注:3% 瓊脂糖TAE電(diàn)泳中,溴酚藍大小(xiǎo)約為(wèi)20bp,二甲苯菁大小(xiǎo)約200bp。

3. 紫外燈下(xià)觀察條帶。

注:使用EB或Goldview染料時,由于染料本身帶正電(diàn)荷較多(duō),随著(zhe)電(diàn)泳時間的延長(cháng),染料會(huì)向陰極聚集,導緻小(xiǎo)片段核酸結合的染料含量降低(dī),會(huì)出現小(xiǎo)片段的DNA片段紫外燈下(xià)亮度變弱或不可見(jiàn)。此時可以将膠浸泡于含有染料的1×TAE緩沖液中染色15-20分鍾即可看(kàn)到(dào)小(xiǎo)片段。

4. 實驗示例:



 


使用RTM441 20bp DNA ladder産品發表部分文章列表:

1. [2022 IF=6] A novel ?uorescent sensor based on aptamer recognition and DNA walker ampli?cation strategy and its determination of 17b-estradiol.

Author: Yajun Zhang, Licong Jia, Wei Wang, Meng Jiang, Hongying Zhang, LingMei Niu

Marker: RTM441,20bp DNA ladder

Journal: Arabian Journal of Chemistry. 16 (2023) 105340.

Institution:School of Public Health, Hebei Medical University

Paper linkhttps://doi.org/10.1016/j.arabjc.2023.105340

 

 


 
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