動物(wù)核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(組織樣品)
Animal Nuclear and
Cytoplasmic Protein Extraction Kit for Tissues
産品貨号
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名稱
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規格
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RTD8303
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動物(wù)核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(組織樣品)
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50 次
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● 産品簡介:
在研究細胞時經常要研究細胞的不同組份,而研究得最多(duō)的兩個(gè)細胞組份就(jiù)是細胞核和細胞漿。分離核蛋白(bái)和胞漿蛋白(bái),不僅可以用于研究蛋白(bái)在細胞内的定位,而且可以用于轉錄調控方面的研究,例如EMSA(也稱gel
shift),footprinting等。動物(wù)核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(Animal
Nuclear and Cytoplasmic Protein Extraction Kit)提供了一(yī)種比較簡單方便地從(cóng)組織中抽提細胞核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)的方法。約90分鍾就(jiù)可以完成組織細胞核蛋白(bái)與細胞漿蛋白(bái)的分離。抽提得到(dào)的蛋白(bái)可以用于Western,EMSA,footprinting,報(bào)告基因檢測以及酶活力測定等實驗。
本試劑盒是通(tōng)過裂解緩沖液在低(dī)滲透壓條件(jiàn)下(xià),使細胞充分膨脹,破壞細胞膜,釋放(fàng)出細胞漿蛋白(bái),然後通(tōng)過離心得到(dào)完整的細胞核(細胞核可以重懸于細胞核貯存緩沖液中
-80℃貯存);細胞核用核蛋白(bái)提取試劑I裂解,配合核酸酶Benzonase消化掉核酸,離心得到(dào)變性核蛋白(bái);或者使用核蛋白(bái)提取試劑II裂解,離心得到(dào)非變性(活性)核蛋白(bái)。一(yī)般情況下(xià),胞漿蛋白(bái)與核蛋白(bái)之間的交叉污染低(dī)于10%。
對于組織樣品,如果每個(gè)樣品的重量不超過50
mg,本試劑盒可以抽提50個(gè)樣品。
● 産品組成:
産品編号
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名稱
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規格
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貯存
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RTD8303-01
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裂解緩沖液A
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45 ml
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-20℃
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RTD8303-02
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裂解緩沖液B
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1 ml
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4 ℃
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RTD8303-03
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細胞核貯存緩沖液
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0.5 ml
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-20℃
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RTD8303-04
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核蛋白(bái)提取試劑I(變性)
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5 ml
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-20℃
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RTD8303-05
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核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)
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5 ml
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-20℃
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RTD8303-06
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台盼藍染色液
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0.5 ml
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4℃
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PM1790S-01
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PMSF溶液(100 mM)
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1 ml
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-20℃
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RTT2106-01
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Benzonase(250 U/μl)
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50 μl
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-20℃
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DT0140P-01
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1 M DTT
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1 ml
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4℃(配制後-20℃)
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● 貯存條件(jiàn)和運輸:
根據标簽溫度貯存;有效期一(yī)年(nián);試劑盒濕冰運輸。
● 用前必讀(dú):
1. 離心機(jī)請調整成RCF/g模式,按照(zhào)離心力設置離心機(jī)(不要根據轉速rpm模式設置),所有離心步驟都需要在4℃低(dī)溫離心機(jī)中進行。
2. 蛋白(bái)提取推薦添加蛋白(bái)酶抑制劑,根據蛋白(bái)酶抑制劑母液濃度提前添加在蛋白(bái)提取溶液中(如抑制劑母液是 100×,添加時按照(zhào)1:100添加)。研究蛋白(bái)磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)。
3. 蛋白(bái)定量推薦使用BCA方法,可以選擇BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)。
● 使用方法:
一(yī) 胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)的提取:
1.1準備溶液:常溫溶解試劑盒中的試劑,溶解後立即放(fàng)置在冰上(shàng),混勻。取适當量的裂解緩沖液A,在使用前加入PMSF溶液和/或磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)和1/1000體積的1
M DTT,随後立即放(fàng)于冰上(shàng)待用。
組份
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一(yī)次提取需要體積
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PMSF溶液
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1
M DTT
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Benzonase
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裂解緩沖液A
(步驟1.2.2和1.3.1)
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800 μl
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8 μl
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0.8 μl
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-
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核蛋白(bái)提取試劑I(變性)
(步驟1.4.1.2)
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100 μl
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1 μl
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0.1 μl
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1 μl
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核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(步驟1.4.2.2)
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50 μl
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0.5 μl
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-
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-
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1.2
組織胞漿蛋白(bái)提取:
1.2.1把組織盡可能(néng)切成非常細小(xiǎo)的碎片。
1.2.2按照(zhào)每50
mg組織加入400
μl裂解緩沖液A(含抑制劑和DTT)的比例在玻璃勻漿器(qì)内充分勻漿,勻漿需在冰浴進行,勻漿後吸出勻漿液到(dào)離心管中,冰浴5分鍾。
1.2.3
關鍵步驟:加入20
μl裂解緩沖液B(按照(zhào)裂解緩沖液A體積的1/20加入),混勻,冰浴5-10分鍾。
注1:此步驟盡量不要漩渦震蕩沉澱,否則得到(dào)的胞漿蛋白(bái)可能(néng)會(huì)污染核蛋白(bái)。
注2:裂解緩沖液對不同組織細胞的裂解能(néng)力有不同,敏感細胞裂解5分鍾足夠,其他細胞冰浴時間不要超過10分鍾。
1.2.4
4℃ 16000g 離心5分鍾,取80%上(shàng)清即為(wèi)胞漿蛋白(bái),保存備用。
注:吸取上(shàng)清時千萬不要觸及沉澱,可以隻取80%體積上(shàng)清,以免胞漿蛋白(bái)中污染細胞核。新鮮的肝髒組織用本産品裂解後獲得的上(shàng)清,其胞漿蛋白(bái)濃度約為(wèi)2-5
mg/ml,不同狀态的不同組織有所不同。
1.3
收集細胞核:
1.3.1
徹底去除步驟1.2.4離心管内上(shàng)清,沉澱中再次加入400
μl裂解緩沖液A(含PMSF
和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸沉澱至沉澱完全散開(kāi)(注:渦旋震蕩不易懸浮沉澱),冰浴5分鍾。
注:此步驟目的是徹底漂洗沉澱中殘餘的未裂解細胞,可以大大提高(gāo)細胞核的純度。
1.3.2
4℃ 16000g 離心5-10分鍾,徹底去除上(shàng)清,沉澱即為(wèi)完整的細胞核。
注:盡量完全把上(shàng)清去除幹淨,否則細胞核中會(huì)污染胞漿蛋白(bái)。
1.3.4
可選步驟:取10
μl細胞核溶液,加入10
μl台盼藍染色液,混勻後,常溫放(fàng)置2分鍾,顯微鏡下(xià)觀察細胞核的染色情況,提取良好的細胞核為(wèi)均一(yī)藍色,沒有粘連(如圖)。
1.4 細胞核蛋白(bái)提取:
1.4.1 變性核蛋白(bái)提取:
注:此步驟使用含有SDS的核蛋白(bái)提取試劑I,完全裂解核膜,釋放(fàng)出細胞核内容物(wù),提取的是完全變性的核蛋白(bái),适用于SDS-PAGE電(diàn)泳Western
Blot檢測。
1.4.1.1
取一(yī)管50
μl細胞核溶液,4℃
16000g 離心2分鍾,去除上(shàng)清,保留沉澱。
1.4.1.2
沉澱中加入100
μl核蛋白(bái)提取試劑I(變性)(含PMSF和DTT)和1
μl Benzonase,吸頭重懸沉澱,37℃處理30分鍾至幾乎無可見(jiàn)不溶物(wù)。
注:加入核蛋白(bái)提取試劑I(變性)後,細胞核裂解釋放(fàng)出大量核酸,溶液可能(néng)非常粘稠,核酸酶Benzonase可以消化掉核酸,降低(dī)粘度。
1.4.1.3
4℃16,000g離心10分鍾,立即吸取上(shàng)清至一(yī)預冷的離心管中,即為(wèi)抽提得到(dào)的變性核蛋白(bái)。可以立即使用,也可以-80℃凍存。新鮮的50 mg肝髒組織用100 μl提取試劑I裂解後獲得的上(shàng)清,可以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其核蛋白(bái)濃度約為(wèi)1-3
μg/μl,不同細胞略有不同。
1.4.2 非變性核蛋白(bái)提取:
注:此步驟使用高(gāo)鹽緩沖液(核蛋白(bái)提取試劑II)使得細胞核收縮,核酸結合蛋白(bái)(如轉錄因子)與核酸分離,擴散到(dào)細胞核外部,離心後上(shàng)清中為(wèi)非變性(活性)核蛋白(bái),适用EMSA,轉錄因子活性分析等實驗。
1.4.2.1
取一(yī)管50
μl細胞核溶液,4℃
16000g 離心2分鍾,去除上(shàng)清,保留沉澱。
1.4.2.2
沉澱中加入50
μl核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(含PMSF,不要添加DTT),吸頭重懸沉澱,4℃旋轉混勻30
min,至最後得到(dào)的溶液無可見(jiàn)懸浮物(wù)。
注:如不能(néng)旋轉混勻,可以冰浴30 min,每隔5分鍾混勻一(yī)次。
1.4.2.3
4℃16,000g離心10分鍾,立即吸取上(shàng)清至一(yī)預冷的離心管中,即為(wèi)抽提得到(dào)的活性核蛋白(bái)。可以立即使用,也可以-80℃凍存。新鮮的50 mg肝髒組織用50 μl提取試劑II裂解後獲得的上(shàng)清,可以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其核蛋白(bái)濃度約為(wèi)1-3
μg/μl,不同細胞略有不同。
二 關于胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)産量和質量的評價:
2.1蛋白(bái)産量:
組織
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組織重量
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胞漿蛋白(bái)
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核蛋白(bái)
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腦(nǎo)
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~50 mg
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~1.2 mg
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~70 μg
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肝髒
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~50 mg
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~3.4 mg
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~80 μg
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心髒
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~50 mg
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~1.6 mg
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~140 μg
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肺
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~50 mg
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~1.5 mg
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~70 μg
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2.2 胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)質量評價:
蛋白(bái)分區提取的質量評價首先看(kàn)提取的蛋白(bái)是否是分區蛋白(bái),其次要看(kàn)分區蛋白(bái)是否有明顯的富集,其三要看(kàn)提出的分區蛋白(bái)是否有其他組分交叉污染,最後看(kàn)提取的分區蛋白(bái)中是否可以檢測出目的蛋白(bái)。使用專門(mén)的胞漿内參和細胞核内參(下(xià)表),可以初步确認提出的是胞漿蛋白(bái)還(hái)是核蛋白(bái)。蛋白(bái)是否有效富集需要用總蛋白(bái)作為(wèi)對照(zhào),與總蛋白(bái)相(xiàng)比,胞漿蛋白(bái)内參或核内參是否有明顯富集。交叉污染可以用其他組分内參檢測蛋白(bái)樣品,如關注胞漿蛋白(bái)中是否有細胞核蛋白(bái)污染,可以使用核蛋白(bái)内參如Lamin
B1檢測胞漿蛋白(bái),檢測無條帶即說明胞漿蛋白(bái)與細胞核組分無交叉污染。用目标蛋白(bái)抗體檢測分區蛋白(bái),驗證是否可以檢測到(dào)目的蛋白(bái),蛋白(bái)大小(xiǎo)是否符合預期。
位置
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内參名稱
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大小(xiǎo) kD
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備注
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胞漿蛋白(bái)内參
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GAPDH
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37
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β-Actin
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45
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β-Tubulin
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55
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推薦
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核内參
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Histone H3
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17
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H3出存在于細胞核内,也存在于線粒體中,胞漿中可以檢測到(dào)
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PCNA
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36
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Lamin B1
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68
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推薦
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