動物(wù)核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(細胞樣品)
Animal Nuclear and
Cytoplasmic Protein Extraction Kit for Cells
産品貨号
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名稱
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規格
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RTD8301
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動物(wù)核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(細胞樣品)
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50 次
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● 産品簡介:
在研究細胞時經常要研究細胞的不同組份,而研究得最多(duō)的兩個(gè)細胞組份就(jiù)是細胞核和細胞漿。分離核蛋白(bái)和胞漿蛋白(bái),不僅可以用于研究蛋白(bái)在細胞内的定位,而且可以用于轉錄調控方面的研究,例如EMSA(也稱gel
shift),footprinting等。動物(wù)核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)提取試劑盒(Animal
Nuclear and Cytoplasmic Protein Extraction Kit)提供了一(yī)種比較簡單方便地從(cóng)培養細胞中抽提細胞核蛋白(bái)與胞漿蛋白(bái)的方法。約90分鍾就(jiù)可以完成培養細胞的細胞核蛋白(bái)與細胞漿蛋白(bái)的分離。抽提得到(dào)的蛋白(bái)可以用于Western,EMSA,footprinting,報(bào)告基因檢測以及酶活力測定等實驗。
本試劑盒是通(tōng)過細胞核提取緩沖液在低(dī)滲透壓條件(jiàn)下(xià),使細胞充分膨脹,破壞細胞膜,釋放(fàng)出細胞漿蛋白(bái),然後通(tōng)過離心得到(dào)完整的細胞核(細胞核可以重懸于細胞核貯存緩沖液中
-80℃貯存);細胞核用核蛋白(bái)提取試劑I裂解,配合核酸酶Benzonase消化掉核酸,離心得到(dào)變性核蛋白(bái);或者使用核蛋白(bái)提取試劑II裂解,離心得到(dào)非變性(活性)核蛋白(bái)。一(yī)般情況下(xià),胞漿蛋白(bái)與核蛋白(bái)之間的交叉污染低(dī)于10%。
對于細胞樣品,如果每個(gè)樣品的數量5×106-1×107,本試劑盒可以抽提50個(gè)樣品。
● 産品組成:
産品編号
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名稱
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規格
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貯存
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RTD8301-01
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細胞裂解緩沖液A
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45 ml
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-20℃
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RTD8301-02
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細胞裂解緩沖液B
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1 ml
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4 ℃
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RTD8301-03
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細胞核貯存緩沖液
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0.5 ml
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-20℃
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RTD8301-04
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核蛋白(bái)提取試劑I(變性)
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5 ml
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-20℃
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RTD8301-05
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核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)
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5 ml
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-20℃
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RTD8301-06
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台盼藍染色液
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0.5 ml
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4℃
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PM1790S-01
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PMSF溶液(100 mM)
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1 ml
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-20℃
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RTT2106-01
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Benzonase(250 U/μl)
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50 μl
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-20℃
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DT0140P-01
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1 M DTT
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1 ml
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4℃(配制後-20℃)
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● 貯存條件(jiàn)和運輸:
根據标簽溫度貯存;有效期一(yī)年(nián);試劑盒濕冰運輸。
● 用前必讀(dú):
1. 離心機(jī)請調整成RCF/g模式,按照(zhào)離心力設置離心機(jī)(不要根據轉速rpm模式設置),所有離心步驟都需要在4℃低(dī)溫離心機(jī)中進行。
2. 蛋白(bái)提取推薦添加蛋白(bái)酶抑制劑,根據蛋白(bái)酶抑制劑母液濃度提前添加在蛋白(bái)提取溶液中(如抑制劑母液是 100×,添加時按照(zhào)1:100添加)。研究蛋白(bái)磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)。
3. 蛋白(bái)定量推薦使用BCA方法,可以選擇BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)。
● 使用方法:
一(yī) 胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)的提取:
1.
1準備溶液:常溫溶解試劑盒中的試劑,溶解後立即放(fàng)置在冰上(shàng),混勻。取适當量的細胞裂解緩沖液A,在使用前加入PMSF溶液和/或磷酸酶抑制劑(自(zì)備,試劑盒不提供)和1/1000體積的1
M DTT,随後立即放(fàng)于冰上(shàng)待用。
組份
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一(yī)次提取需要體積
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PMSF溶液
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1
M DTT
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Benzonase
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細胞裂解緩沖液A
(步驟1.4.1和1.5.1)
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800 μl
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8 μl
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0.8 μl
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-
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核蛋白(bái)提取試劑I(變性)
(步驟1.6.1.2)
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100 μl
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1 μl
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0.1 μl
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1 μl
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核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(步驟1.6.2.2)
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50 μl
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0.5 μl
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-
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-
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1.2
準備細胞:
1.2.1
對于貼壁細胞:用PBS漂洗一(yī)遍,棄PBS;再加入适量PBS,用細胞刮刀刮下(xià)細胞,或用0.02%
EDTA(0.5
mM)溶液處理細胞使細胞不再貼壁很緊,并用移液器(qì)吹打下(xià)細胞。450
g 4℃離心5
min收集細胞,盡最大努力吸盡上(shàng)清,留下(xià)細胞沉澱備用。盡量避免用胰酶消化細胞,以免胰酶降解需抽提的目的蛋白(bái)。
1.2.2
對于懸浮細胞:450
g 4℃離心5
min收集細胞,用PBS洗一(yī)遍,離心收集細胞,盡最大努力吸盡上(shàng)清,留下(xià)細胞沉澱備用。
1.3 按照(zhào)下(xià)表大體估算(suàn)提取溶液使用體積:
細胞類型
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培養器(qì)皿
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細胞數量
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細胞沉澱體積(PCV)(μl)
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細胞裂解緩沖液A(μl)
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懸浮細胞
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5-10×106
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>50
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400
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貼壁細胞
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96孔闆
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~1×105
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調整細胞數目到(dào)5-10×106
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24孔闆
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~5×105
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調整細胞數目到(dào)5-10×106
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6孔闆
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~2.5×106
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調整細胞數目到(dào)5-10×106
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25cm2培養瓶
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~2×106
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調整細胞數目到(dào)5-10×106
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75cm2培養瓶
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~8×106
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~80
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35
mm培養皿
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~2×106
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調整細胞數目到(dào)5-10×106
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60
mm培養皿
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~5×106
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~50
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100
mm培養皿
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~1.5×107
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調整細胞數目到(dào)5-10×106
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注:(二百萬,2×106)HeLa細胞,其細胞沉澱體積(PCV,Packed Cell Volume)大約為(wèi)20 μl。
1.4
胞漿蛋白(bái)提取:
1.4.1細胞沉澱中加入準備好的400
μl細胞裂解緩沖液A(含抑制劑和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸細胞沉澱5-10次,把細胞沉澱完全懸浮并分散開(kāi),冰浴5分鍾。
1.4.2
加入20
μl 細胞裂解緩沖液B(按照(zhào)細胞裂解緩沖液A體積的1/20加入),混勻,冰浴5-10分鍾。
注1:此步驟盡量不要漩渦震蕩沉澱,否則得到(dào)的細胞漿蛋白(bái)可能(néng)會(huì)污染核蛋白(bái)。
注2:裂解緩沖液對不同細胞的裂解能(néng)力有不同,敏感細胞裂解5分鍾足夠,其他細胞冰浴時間不要超過10分鍾。
1.4.3
4℃ 16000g 離心5分鍾,取80%上(shàng)清即為(wèi)胞漿蛋白(bái),保存備用。
注:吸取上(shàng)清時千萬不要觸及沉澱,可以隻取80%體積上(shàng)清,以免胞漿蛋白(bái)中污染細胞核。每5-10×106細胞用400
μl細胞裂解緩沖液A裂解後獲得的上(shàng)清,其細胞漿蛋白(bái)濃度約為(wèi)1-2 μg/μl,不同細胞略有不同。
1.5
收集細胞核:
1.5.1
徹底去除步驟1.4.3離心管内上(shàng)清,沉澱中再次加入400
μl細胞裂解緩沖液A(含PMSF和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸沉澱至沉澱完全散開(kāi)(注:渦旋震蕩不易懸浮沉澱),冰浴5分鍾。
注:此步驟目的是徹底漂洗沉澱中殘餘的未裂解細胞,可以大大提高(gāo)細胞核的純度
1.5.2
4℃ 16000g 離心5-10分鍾,徹底去除上(shàng)清,沉澱即為(wèi)完整的細胞核。
注:盡量完全把上(shàng)清去除幹淨,否則細胞核中會(huì)污染胞漿蛋白(bái)。
1.5.3
細胞核沉澱中加入50
μl細胞核貯存緩沖液,用吸頭完全重懸沉澱,得到(dào)細胞核溶液。該溶液可以-80℃貯存。
1.5.4 可選步驟:取10 μl細胞核溶液,加入10 μl台盼藍染色液,混勻後,常溫放(fàng)置2分鍾,顯微鏡下(xià)觀察細胞核的染色情況,提取良好的細胞核為(wèi)均一(yī)藍色,沒有粘連(如圖)。
pt;mso-ansi-language:EN-US;
mso-fareast-language:ZH-CN;mso-bidi-language:AR-SA'>可選步驟:取10 μl細胞核溶液,加入10 μl台盼藍染色液,混勻後,常溫放(fàng)置2分鍾,顯微鏡下(xià)觀察細胞核的染色情況,提取良好的細胞核為(wèi)均一(yī)藍色,沒有粘連(如圖)。
1.6 細胞核蛋白(bái)提取:
1.6.1 變性核蛋白(bái)提取:
注:此步驟使用含有SDS的提取試劑B,完全裂解核膜,釋放(fàng)出細胞核内容物(wù),提取的是完全變性的核蛋白(bái),适用于SDS-PAGE電(diàn)泳Western
Blot檢測。
1.6.1.1
取一(yī)管50
μl細胞核溶液,4℃
16000g 離心2分鍾,去除上(shàng)清,保留沉澱。
1.6.1.2
沉澱中加入100
μl核蛋白(bái)提取試劑I(變性)(含PMSF和DTT)和1
μl Benzonase,吸頭重懸沉澱,37℃處理30分鍾至幾乎無可見(jiàn)不溶物(wù)。
注:加入核蛋白(bái)提取試劑I(變性)後,細胞核裂解釋放(fàng)出大量核酸,溶液非常粘稠,核酸酶Benzonase可以消化掉核酸,降低(dī)粘度。
1.6.1.3
4℃16,000g離心10分鍾,立即吸取上(shàng)清至一(yī)預冷的離心管中,即為(wèi)抽提得到(dào)的變性核蛋白(bái)。可以立即使用,也可以-80℃凍存。每5-10×106細胞用100微升提取試劑B裂解後獲得的上(shàng)清,可以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其核蛋白(bái)濃度約為(wèi)1-3
μg/μl,不同細胞略有不同。
1.6.2 非變性核蛋白(bái)提取:
注:此步驟使用高(gāo)鹽緩沖液使得細胞核收縮,核酸結合蛋白(bái)(如轉錄因子)與核酸分離,擴散到(dào)細胞核外部,離心後上(shàng)清中為(wèi)非變性(活性)核蛋白(bái),适用EMSA,轉錄因子活性分析等實驗。
1.6.2.2
沉澱中加入50
μl核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)(含PMSF,不要添加DTT),吸頭重懸沉澱,4℃旋轉混勻30
min,至最後得到(dào)的溶液無可見(jiàn)懸浮物(wù)。
注:如不能(néng)旋轉混勻,可以冰浴30 min,每隔5分鍾混勻一(yī)次。
1.6.2.3
4℃16,000g離心10分鍾,立即吸取上(shàng)清至一(yī)預冷的離心管中,即為(wèi)抽提得到(dào)的活性核蛋白(bái)。可以立即使用,也可以-80℃凍存。每5-10×106細胞用50微升核蛋白(bái)提取試劑II(非變性)裂解後獲得的上(shàng)清,可以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)測定濃度,其細胞核蛋白(bái)濃度約為(wèi)1-3
μg/μl,不同細胞略有不同。
二 關于胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)産量和質量的評價:
2.1蛋白(bái)産量:
細胞系
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細胞數量
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胞漿蛋白(bái)
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核蛋白(bái)
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K562
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1×107
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~0.8 mg
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~0.2 mg
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HEK293
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4×107
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~9.4 mg
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~0.55 mg
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Jurkat
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1.5×107
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~2.6 mg
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~0.23 mg
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Hela
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5.4×106
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~1.9 mg
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~0.34 mg
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NIH-3T3
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7.9×106
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~1.9 mg
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~0.28 mg
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2.2 胞漿蛋白(bái)和核蛋白(bái)質量評價:
蛋白(bái)分區提取的質量評價首先看(kàn)提取的蛋白(bái)是否是分區蛋白(bái),其次要看(kàn)分區蛋白(bái)是否有明顯的富集,其三要看(kàn)提出的分區蛋白(bái)是否有其他組分交叉污染,最後看(kàn)提取的分區蛋白(bái)中是否可以檢測出目的蛋白(bái)。使用專門(mén)的胞漿内參和細胞核檢測(下(xià)表),可以初步确認提出的是胞漿蛋白(bái)還(hái)是核蛋白(bái)。蛋白(bái)是否有效富集需要用總蛋白(bái)作為(wèi)對照(zhào),與總蛋白(bái)相(xiàng)比,胞漿蛋白(bái)内參或核内參是否有明顯富集。交叉污染可以用其他組分内參檢測蛋白(bái)樣品,如關注胞漿蛋白(bái)中是否有細胞核蛋白(bái)污染,可以使用核蛋白(bái)内參如Lamin
B1檢測胞漿蛋白(bái),檢測無條帶即說明胞漿蛋白(bái)與細胞核組分無交叉污染。用目标蛋白(bái)抗體檢測分區蛋白(bái),驗證是否可以檢測到(dào)目的蛋白(bái),蛋白(bái)大小(xiǎo)是否符合預期。
位置
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内參名稱
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大小(xiǎo) kD
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胞漿蛋白(bái)内參
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GAPDH
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37
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β-Actin
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45
|
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β-Tubulin
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55
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推薦
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核内參
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Histone H3
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17
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存在于線粒體中,胞漿中可以檢測到(dào)
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PCNA
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36
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Lamin B1
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68
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推薦
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三 實驗示例:
Jurkat總蛋白(bái),細胞漿蛋白(bái),細胞核蛋白(bái)GAPDH檢測
總蛋白(bái)提取:4×106 K562細胞,400 g 離心收集,去上(shàng)清,沉澱中加入200
μl RIPA(加2 μl 100 mM PMSF),冰上(shàng)裂解5分鍾,4℃
16000 g 15 分鍾,上(shàng)清即為(wèi)總蛋白(bái)(TP)。
細胞漿蛋白(bái):4×106 K562細胞,400 g 離心收集,加入400
μl細胞裂解緩沖液A (加4
μl 100mM PMSF,加0.4 μl 1 M DTT),懸浮沉澱,冰浴5分鍾;加入20
μl細胞裂解緩沖液B,混勻,冰上(shàng)孵育5分鍾,4℃
16000g 5分鍾,小(xiǎo)心收集上(shàng)清即為(wèi)細胞漿蛋白(bái)(CP),不要觸及沉澱。
細胞核蛋白(bái)提取:沉澱中計入100
μl核蛋白(bái)提取試劑I(變性),1
μl Benzonase,37℃ 30 min,4
℃ 16000 g 10分鍾,上(shàng)清即為(wèi)細胞核蛋白(bái)(NP)。
電(diàn)泳:RTD6117-0420 200V 33-12 mA 55 min
轉膜:NC膜,1×RealBlot快速轉膜液濕轉,穩流400
mA,電(diàn)壓變化64-57 V,轉膜時間35
min
封閉:無蛋白(bái)快速封閉液RT 10 min
一(yī)抗孵育;二抗孵育;檢測:ECL發光(guāng)檢測