SDS裂解液
● 産品包裝:
貨号
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名稱
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規格
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RL1060
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SDS裂解液
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100
ml
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● 産品簡介:
SDS裂解液(SDS Lysis Buffer)是一(yī)種比較強烈的細胞組織裂解液,其主要成分是Tris (pH8.0), SDS,EDTA等。SDS裂解液裂解得到(dào)的蛋白(bái)樣品可以用于常規的Western、ChIP(染色質免疫共沉澱,chromatin immunoprecipitation)等。由于SDS裂解液有較強的裂解能(néng)力,IP或Co-IP實驗不建議使用該裂解液。由于含有較高(gāo)濃度的SDS等幹擾物(wù)質,不能(néng)用傳統Bradford法測定由本裂解液裂解得到(dào)樣品的蛋白(bái)濃度,可以使用BCA蛋白(bái)濃度測定試劑盒(貨号:RTP7102)或Bradford蛋白(bái)濃度測定試劑盒(去垢劑兼容型)(貨号:RTP7104)測定蛋白(bái)濃度。
● 貯存、效期及運輸:
常溫保存;有效期2年(nián);常溫運輸。
● 注意事(shì)項:
1. 需自(zì)備蛋白(bái)酶抑制劑如PMSF。
2. 如果使用本SDS裂解液用于ChIP實驗,在對超聲後基因組DNA大小(xiǎo)進行檢測時,如果采用瓊脂糖凝膠中添加花菁素類染料如GelRed或類似染料或使用含該類染料的DNA上(shàng)樣緩沖液時,由于電(diàn)泳時SDS會(huì)與此類染料結合形成異常條帶,條帶通(tōng)常在600-1000 bp左右,因此會(huì)對超聲後基因組DNA大小(xiǎo)的判斷造成一(yī)定的影響。建議采用後染方法即“電(diàn)泳完畢後對瓊脂糖凝膠染色”的方式進行條帶大小(xiǎo)的檢測,使用該方法不會(huì)有異常條帶出現,不影響對超聲後基因組DNA大小(xiǎo)的判斷,而且條帶大小(xiǎo)更準确。
● 使用說明:
1. 準備SDS裂解液:
取适當量的裂解液,在使用前數分鍾内加入1/100體積的100 mM PMSF(貨号:PM1790),使PMSF的最終濃度為(wèi)1 mM或加入其他蛋白(bái)酶抑制劑。
注:SDS裂解液低(dī)溫會(huì)析出結晶,以下(xià)操作需保持常溫操作。
2. 細胞蛋白(bái)提取:
2.1 貼壁細胞:去除培養液,加入适量1×PBS,輕柔漂洗一(yī)遍,不要擾動貼壁細胞。按照(zhào)6孔闆每孔加入100-200 μl裂解液的比例加入裂解液,移液器(qì)吹打數下(xià),使裂解液和細胞充分接觸,用細胞刮刀刮下(xià)細胞收集于1.5 ml離心管中。
培養闆規格/培養皿表面積
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細胞量
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裂解液推薦使用量
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100 mm培養皿
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1.5×107
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0.5-1 ml
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60 mm培養皿
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5×106
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0.25-0.5 ml
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35 mm培養皿
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2×106
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0.2-0.4 ml
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6孔闆
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2.5×106
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100-200 μl
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24孔闆
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5×105
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100-150 μl
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96孔闆
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1×105
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50-100 μl
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2.2 懸浮細胞:450 g 4℃ 離心5 min收集細胞;用适量1×PBS重懸細胞,450 g 4℃ 離心5 min收集細胞;重複漂洗細胞一(yī)次;按照(zhào)細胞沉澱體積(PCM)20 μl加入200 μl 裂解液的比例加入SDS裂解液,混勻細胞沉澱。
注:2×106 Jurkat細胞,其細胞沉澱體積(PCM,Packed Cell Volume)大約為(wèi)20 μl。
2.3 裂解細胞:
2.3.1 裂解混合物(wù)超聲波處理(超聲條件(jiàn)根據儀器(qì)調整);如沒有超聲破碎儀,可以使用注射器(qì)用27G針頭處理裂解物(wù)10-15次(貨号:PE2719 ,蛋白(bái)提取針頭套裝),以徹底裂解細胞。
注:裂解中細胞會(huì)釋放(fàng)出變性的核酸,呈團狀粘稠透明樣,如不進行超聲或針頭裂解處理,會(huì)導緻裂解物(wù)非常粘稠,大大降低(dī)蛋白(bái)提取的得率和純度。
2.3.2 裂解物(wù)95℃處理10分鍾,間歇混勻。
2.4 離心收集上(shàng)清:
充分裂解後,常溫16000 g離心10分鍾,取上(shàng)清,即可進行後續的PAGE、Western等操作。
3. 組織蛋白(bái)提取:
3.1 手術(shù)切除的組織塊迅速置于預冷的生(shēng)理鹽水(shuǐ)中,漂洗數次,洗淨組織血迹,用濾紙(zhǐ)吸
幹組織表面液體,将組織切成細小(xiǎo)的碎片。
3.2 按照(zhào)每20 mg組織加入200 μl裂解液的比例加入裂解液。(如果裂解不充分可以适當添加更多(duō)的裂解液,如果需要高(gāo)濃度的蛋白(bái)樣品,可以适當減少裂解液的用量。)
3.3 用玻璃勻漿器(qì)勻漿5-10次,收集勻漿後的裂解混合物(wù),超聲波處理(超聲條件(jiàn)根據儀器(qì)調整);如沒有超聲破碎儀,可以使用注射器(qì)用27G針頭處理裂解物(wù)10-15次(貨号:PE2719 ,蛋白(bái)提取針頭套裝),以徹底裂解細胞。
注:裂解中細胞會(huì)釋放(fàng)出變性的核酸,呈團狀粘稠透明樣,如不進行超聲或針頭裂解處理,會(huì)導緻裂解物(wù)非常粘稠,大大降低(dī)蛋白(bái)提取的得率和純度。
3.4 裂解物(wù)95℃處理10分鍾,間歇混勻。
3.5 常溫16000 g離心10分鍾,取上(shàng)清,即可進行後續的PAGE、Western等操作。
● 實驗示例:
4-18% RealPAGE 預制膠
電(diàn)泳條件(jiàn):1×TGS 穩壓200V
38-13mA 50min;染色:FastBlue蛋白(bái)染色液染色30min。
樣品1(LD直裂):2 ml K562細胞(6.5×106/ml),3000rpm
5min,沉澱用PBS清洗1次,離心後徹底去除PBS,加入130 μl超純水(shuǐ),100 μl5×loading
buffer(變性,還(hái)原),95度10 min,上(shàng)樣5 μl。
樣品2(4K-BME):1 ml 4K細菌細胞(O/N培養),13000 rpm 5min,離心後徹底去除殘餘液體,加入130 μl超純水(shuǐ),100 μl
5×loading buffer,95度10min,上(shàng)樣7.5 μl。
樣品3:1 ml K562細胞(5×106/ml),3000 rpm 5
min,沉澱用PBS清洗1次,離心後徹底去除PBS,加入500 μl SDS裂解緩沖液,超聲處理(10%功率,開(kāi)5S,關10S,2min),冰浴10 min或95度10min,間歇混勻,13000 rpm低(dī)溫離心10 min,取上(shàng)清即為(wèi)總蛋白(bái)。加入5×loading
buffer(變性,還(hái)原)調整樣品濃度為(wèi)2 μg/μl,95度5min,上(shàng)樣5,7.5和10 μl。